Cu toate ca s-au facut schimbari majore la "controls", jocul este similar cu originalul Sensible Soccer. Jucatorul este vazut dintr-un unghi overhead, putand sa faca sau pase scurte, sau cross-uri lungi si apoi sa suteze,o sageata la picioarele jucatorului indicand traiectoria mingii de fotbal. Ca si in celalalt joc Sensible Soccer, se poate aplica o cantitate enorma de aftertouch suturilor lungi, permitandu-ti sa indoi mingea in poarta sau sa agati un jucator dupa ce ai trecut de el. Jucatorii pot acum sa sprinteze cu o singura apasare a butonului, cu toate acestea ei au o cantitate limitata de stamina, pe care trebuie sa o foloseasca strategic de-a lungul meciului. Poti sa driblezi apropiindu-te de adversar si apsand butonul de pasare,i n acelasi timp poti sa si pasezi lung, dar aceasta varianta este mai riscanta. Sensible Soccer 2006 dispune de toate cupele si ligile care exista in echipele europene reale, dar poti de asemenea sa alegi sa-ti construiesti tu echipa proprie si sa urmezi competitii pentru a o imbunatati. Neavand liceenta oficiala FIFA, numele jucatorilor si ale echipelor nu sunt reale, dar pot fi editate dupa bunul plac in orice fel posibil.